Milnacipran (čak i pri koncentracijama 25 puta većim od prosjeka) ne utječe na sustav mikrosomalne oksidacije u hepatocitima (CYP1A2, CYP2A6, CYP2B6, CYP2C8, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP3A4 / 5) pa se ne očekuje interakcija s induktorima i inhibitori mikrosomalne oksidacije.
Karbamazepin, fluoksetin, lorazepam - nema interakcije s milnacipranom.
Klomipramin - pri prijelazu bolesnika s klomipraminom (75 mg / dan) u milnacipran (100 mg / dan) nije došlo do značajnih promjena u farmakokinetičkim parametrima potonjeg. Istodobno, u tim slučajevima pacijentima je potrebno pažljivije promatranje, budući da s takvim prijenosom (bez razdoblja pranja) dolazi do češće euforije i posturalne hipotenzije, a povećava se i rizik od razvoja serotoninskog sindroma.
Neselektivni inhibitori MAO (iproniazid) - povećava se rizik od serotoninskog sindroma. Nakon prestanka liječenja MAO inhibitorom, prije početka liječenja milnacipranom potrebna je stanka od 2 tjedna, a pauza nakon završetka liječenja milnacipranom i prije početka inhibitora MAO treba biti najmanje 1 tjedan.
Selektivni MAO inhibitor tipa B (selegilin) - povećava se rizik od naglog povišenja krvnog tlaka. Nakon prestanka liječenja selektivnim inhibitorom MAO B, prije početka liječenja milnacipranom potrebna je pauza od 2 tjedna, te interval nakon završetka liječenja milnacipranom i prije početka uzimanja selektivnog MAO inhibitora tipa B treba biti najmanje 1 tjedan.
Agonisti serotoninskih receptora 5-HT1D (uključujući sumatriptan) povećavaju rizik od izraženog povišenja krvnog tlaka, grča koronarnih arterija kao posljedice kumulacije serotonergičkog djelovanja lijekova. Od kraja liječenja milnacipranom do početka tijeka terapije agonistima 5-HT1D serotoninskih receptora potrebno je napraviti pauzu u trajanju od 1 tjedna.
Srčani glikozidi (uključujući digoksin) - povećava se rizik od povećanja ozbiljnosti djelovanja na CAS (osobito s parenteralnim načinom primjene digoksina).
Diuretici - povećavaju rizik od hiponatrijemije.
Litijevi pripravci povećavaju rizik od razvoja serotoninskog sindroma, dok milnacipran ne utječe na farmakokinetiku litijevih pripravaka.
Milnacipran se ne smije koristiti istodobno sa sljedećim lijekovima:
- adrenalin, norepinefrin (parenteralna primjena) - naglo povećanje rizika od povišenja krvnog tlaka uz vjerojatnost poremećaja srčanog ritma (inhibicija hvatanja kateholamina simpatičkim živčanim vlaknima);
- klonidin i drugi lijekovi sličnog mehanizma djelovanja - smanjenje hipotenzivnog učinka klonidina (antagonizam s adrenergičkim receptorima);
- selektivni inhibitori MAO tipa A (moklobemid, toloksaton) - naglo povećanje rizika od razvoja serotoninskog sindroma.